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Ayuda => Pide ayuda aquí => Mensaje iniciado por: JoRdi en 20 dic 2009, 08:48 am

Título: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 20 dic 2009, 08:48 am
Buenas,

Me gustaría saber si alguien conoce algún programa para poder ejecutar unos cd's de unas resonancias magnéticas. En el hospital me han dado unos cd's con dichas pruebas, supongo que ellos deben utilizar el güindos y no los puedo ejecutar, de momento, en GNU/Linux. He intentado abrir la aplicación con el reproductor de películas que viene por defecto en Ubuntu, saliéndome un mensaje informándome que falta el decodificador application/dicom, ¿alguien tiene alguna idea sobre el asunto?, ¿hay algún programa libre que lleve dicho decodificador?, a ver si me podéis encarrilar, para ir directamente al grano, es que últimamente no tengo mucho tiempo y no se ni cuando me voy a poder poner a buscar información sobre esto, gracias de antemano socios.

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: invisible en 20 dic 2009, 08:58 am
Pues ya te podrían haber explicado algo sobre esos ficheros...  :? En fin, ahí llevas algo de luz sobre dicom (http://es.wikipedia.org/wiki/DICOM) y una aplicación para GNU que parece manejarlos: Kradview (http://www.orcero.org/irbis/kradview/index.es.html).
Espero que te funcione, si no ya sabes, a seguir preguntando... q:)
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: jofial en 20 dic 2009, 10:54 am
Hola JoRdi,

Dale una miradita a esta página que va dirigida a los radiólogos (http://cdmedicpacsweb.sourceforge.net/GuiaUsuario.html) que quieren aplicativos GNU, esta otra es de la misma factura (http://cdmedicpacsweb.sourceforge.net/es/index.html#SECTION00040000000000000000) y también tienes información.

SAludos y suerte

Jose
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: Colegota en 20 dic 2009, 13:53 pm
Pero no olvides que la interpretación de esos documentos debe hacerla un especialista cualificado. :lee:
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 20 dic 2009, 20:29 pm
Buenas,

...la interpretación de esos documentos debe hacerla un especialista cualificado.

Por supuesto, eso lo tengo muy claro, pero ya que los tengo en mi poder me gustaría poder echar un vistazo.

Muchas gracias a todos por los enlaces socios :colegas: , en cuanto tenga un momento le echaré un vistazo, ya os diré si consigo ejecutar los cd's.

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 22 dic 2009, 16:24 pm
Buenas,

...una aplicación para GNU que parece manejarlos: Kradview (http://www.orcero.org/irbis/kradview/index.es.html).

He intentado instalar Kradview pero me sale un error durante el proceso :? , me parece que el problema viene de aquí :-?

Código: [Seleccionar]
configure: error: C++ preprocessor "/lib/cpp" fails sanity check
See `config.log' for more details

Código: [Seleccionar]
jordi@JoRdi-pc:~$ cd .kradview-1.1.0
jordi@JoRdi-pc:~/.kradview-1.1.0$ ./configure
checking build system type... x86_64-unknown-linux-gnu
checking host system type... x86_64-unknown-linux-gnu
checking target system type... x86_64-unknown-linux-gnu
checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c
checking for -p flag to install... yes
checking whether build environment is sane... yes
checking for a thread-safe mkdir -p... /bin/mkdir -p
checking for gawk... no
checking for mawk... mawk
checking whether make sets $(MAKE)... yes
checking for style of include used by make... GNU
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables...
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ISO C89... none needed
checking dependency style of gcc... gcc3
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
checking for g++... no
checking for c++... no
checking for gpp... no
checking for aCC... no
checking for CC... no
checking for cxx... no
checking for cc++... no
checking for cl.exe... no
checking for FCC... no
checking for KCC... no
checking for RCC... no
checking for xlC_r... no
checking for xlC... no
checking whether we are using the GNU C++ compiler... no
checking whether g++ accepts -g... no
checking dependency style of g++... none
checking whether g++ supports -Wmissing-format-attribute... no
checking whether g++ supports -Wundef... no
checking whether g++ supports -Wno-long-long... no
checking whether g++ supports -Wnon-virtual-dtor... no
checking how to run the C++ preprocessor... /lib/cpp
configure: error: C++ preprocessor "/lib/cpp" fails sanity check
See `config.log' for more details.
jordi@JoRdi-pc:~/.kradview-1.1.0$ make
echo This package needs first a ./configure
This package needs first a ./configure
jordi@JoRdi-pc:~/.kradview-1.1.0$ make install
make: *** No hay ninguna regla para construir el objetivo `install'.  Alto.
jordi@JoRdi-pc:~/.kradview-1.1.0$

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: sertinell en 22 dic 2009, 16:59 pm
Necesitas instalar los build-essentials.
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: jofial en 22 dic 2009, 17:04 pm
Hola Jordi,

Mirate este post (http://ubuntulife.wordpress.com/2009/05/02/cosas-a-hacer-despues-de-instalar-ubuntu-904-jaunty-jackalope/) alli te dice lo que necesitas para compilarte un programa.

SAludos

Jose
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 22 dic 2009, 19:02 pm
Buenas,

Mirate este post (http://ubuntulife.wordpress.com/2009/05/02/cosas-a-hacer-despues-de-instalar-ubuntu-904-jaunty-jackalope/) alli te dice lo que necesitas para compilarte un programa.

Gracias socio por el enlace q:) , en cuanto tenga un rato libre me lo miro con tranquilidad.

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 19 ene 2010, 19:18 pm
Buenas,

Como se suele decir, el mundo es un pañuelo. El otro día, hablando con un compañero de trabajo, salió una conversación sobre sistemas operativos, mira tu por donde que él también utiliza GNU/Linux (Ubuntu) y su hermano, informático, tiene una empresa de informática y solo trabaja con GNU/Linux :-)

Pues bien, le comenté el tema de las resonancias magnéticas, así que su hermano, al cual agradezco, se tomo un poco de su tiempo libre para encaminarme sobre el buen camino. Lo primero que me recomendó fue instalar, desde los repositorios de Ubuntu, el paquete med-imaging, cosa que ya he hecho, y me invitó a visitar esta web (http://opendicom.sourceforge.net/) y esta otra (http://www.dcm4che.org/).

He estado tanteando esta web (http://opendicom.sourceforge.net/), la primera comentada, y he ido a download (http://opendicom.sourceforge.net/download2.html). Pues bien, aquí tengo cuatro descargas disponibles y no se si debo descargas las cuatro o una de ellas, ¿vosotros como lo veis? :?? , gracias de antemano socios.

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: invisible en 19 ene 2010, 19:42 pm
...
Lo primero que me recomendó fue instalar, desde los repositorios de Ubuntu, el paquete med-imaging, cosa que ya he hecho...
¿Y te ha servido de algo? :??

... aquí tengo cuatro descargas disponibles y no se si debo descargas las cuatro o una de ellas, ¿vosotros como lo veis? :??
Supongo que te vale con el opendicom-navigator, que es el visualizador. No sé si éste requerirá la biblioteca opendicom-sharp. El -doc es eso, documentación; y el plugin para beagle te puede servir en caso de usar beagle. :ejem: El utils son herramientas complementarias para usar desde consola (no sé si te será necesario tenerlas también instaladas para usar el navigator...).
Otra cosa, está programado en mono, por lo que igual necesitas alguna biblioteca extra de mono, pero de esas habrá en ubuntu.


Por cierto, tienes disponible un repositorio svn para instalar directamente desde él, te lo especifica más abajo de las descargas... por si te aburres... :)o

Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 20 ene 2010, 05:58 am
Buenas,

¿Y te ha servido de algo?

Según parece, para que funcionen correctamente las descargas de las páginas webs y hacer posible el funcionamiento de los programas, hay que tener instalado el paquete med-imaging, yo como que no entiendo mucho de todo esto me dejo guiar por expertos.

Por cierto, tienes disponible un repositorio svn para instalar directamente desde él, te lo especifica más abajo de las descargas... por si te aburres...

Muchas gracias por toda la información invi q:) , a ver cuando logro arañar un poco del poco tiempo libre que me queda y me pongo con todo esto.

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: jofial en 20 ene 2010, 06:47 am
Hola Jordi,

Efectivamente parece que med-imaging sirve para interactuar con los visualizadores y programas de imagines digitales, según indica el propio Synaptic:

It installs several packages supporting DICOM (Digital Imaging and
Communications in Medicine) which is the de-facto standard for medical
image management. The standard defines data structures and services for
the exchange of medical images and related information. The latest release
has been published in 2008 and consists of 18 parts.


Traduccion googlegiana ;-)
Se instala varios paquetes de apoyo DICOM (Digital Imaging and
Comunicaciones en medicina) que es el estándar de facto para los médicos
gestión de imágenes. La norma define las estructuras de datos y servicios para
el intercambio de imágenes médicas e información relacionada. La última versión
Se ha publicado en 2008 y consta de 18 partes.


Respecto a los paquetes a instalar del programa de esta web (http://opendicom.sourceforge.net/), estoy de acuerdo con invi, yo solo instalaría el navigator, pero como no domino, lo mejor es que pruebes a instalarlo y te dirá si le falta alguna librería. También es una buena opción bajártelo y compilarlo desde las fuentes.

En el install del programa te indica esto:

Código: [Seleccionar]
The entire installation process is adapted to GNU/Linux platforms
and tested with latest Ubuntu and Mandriva distributions. The
installation on a machine running Windows has to be done manually
at the moment.


Rebuild library:
    make clean
    make

Install library system wide:
    su
    make install

Remove library from system:
    su
    make uninstall

Build monodoc documentation:
    make monodoc

que no parece tener mucha mas complicación.

Animo y al toro...

Saludos

Jose
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: Manolo en 20 ene 2010, 08:17 am

He estado tanteando esta web (http://opendicom.sourceforge.net/), la primera comentada, y he ido a download (http://opendicom.sourceforge.net/download2.html). Pues bien, aquí tengo cuatro descargas disponibles y no se si debo descargas las cuatro o una de ellas, ¿vosotros como lo veis? :?? , gracias de antemano socios.

¿Has probado buscando "dicom" en Synaptic? Yo lo acabo de hacer y he visto varios paquetes relacionados con el proyecto. Simplemente márcalos e instálalos.
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 20 ene 2010, 19:09 pm
Buenas,

Animo y al toro...

A ver si encuentro un momento un rato de estos y cojo el toro por los cuernos :-b

¿Has probado buscando "dicom" en Synaptic? Yo lo acabo de hacer y he visto varios paquetes relacionados con el proyecto.

Instalando med-imaging se instala todo lo que es necesario :-)

Ya os contaré socios, gracias por la información :asias:

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 21 ene 2010, 08:10 am
Buenas,

Ya me he descargado opendicom-navigator, lo he puesto en mi carpeta personal y lo he descomprimido, hasta ahí ningún problema, el problema es que me estoy liando, no consigo instalarlo :-o , ¿que pasos debería seguir para su instalación? :?? , he estado mirando y probando lo que me enlazó jofial pero no doy con la solución, ¡que torpe soy con estas cosas! :torpe: :torpe: :torpe: , gracias de antemano socios.

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: invisible en 21 ene 2010, 08:45 am
... ¿que pasos debería seguir para su instalación? :?? , he estado mirando y probando lo que me enlazó jofial pero no doy con la solución, ¡que torpe soy con estas cosas! :torpe: :torpe: :torpe: , gracias de antemano socios

El código que te ha pegado jofial es el contenido del fichero INSTALL; son las instrucciones para su instalación, y entiendo que las has seguido... ¿dónde te atascas?, ¿qué errores te salen? :??
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: jofial en 21 ene 2010, 17:37 pm
Hola Jordi,

Debes entrar en la carpeta en modo terminal (consola) una vez estés dentro, debes teclear make clean y darle al intro, esperar que acabe y darle make y a partir de ahí... atentos cocinaaaa!!! debes logearte como superusuario con sudo (si tienes ubuntu) tecleando lo siguiente: sudo make install te pedira la contraseña de administrador (superusuario) se la das y a esperar que te lo instale.

Eso es todo y te debería funcionar. En caso de que no sea así, pega los mensajes que te vaya dando en cada uno de los pasos. Como recordatorio:

1.- make clean [intro]
2.- make [intro]
3.- sudo make install (te pedirá clave de administrador se la das, e [intro])

Saludos y suerte (si no te aclaras búscame al chat o me llamas)

Jose
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 21 ene 2010, 19:55 pm
Buenas,

Gracias por la información socios q:) , en cuanto tenga un momento me pongo con ello, a ver si la semana que viene tengo un ratito libre y doy con la solución.

Debes entrar en la carpeta en modo terminal (consola) una vez estés dentro, debes teclear make clean y darle al intro...

Supongo que la carpeta tendrá que estar ubicada en mi Carpeta personal, abrir terminal y seguir tus indicaciones, en principio no tendría que tener problemas, ya os tendré informados.

...¿dónde te atascas?, ¿qué errores te salen?

Los errores que me han salido han sido ficheros no encontrados, pero ahora no recuerdo bien si le he dado las ordenes correctas desde terminal :? , me parece que me he liado :-o

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: invisible en 21 ene 2010, 20:12 pm
Los errores que me han salido han sido ficheros no encontrados, pero ahora no recuerdo bien si le he dado las ordenes correctas desde terminal :? , me parece que me he liado :-o
Tienes que descargar el fichero en un sitio accesible, normalmente se hace en el /home, en el Escritorio o donde quieras. Luego lo descomprimes y te sitúas dentro del directorio ya descomprimido (esto ya lo tienes que hacer desde el terminal cd /loquesea ) y desde ahí ya operas los comandos necesarios.
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 22 ene 2010, 05:19 am
Buenas,

Tienes que descargar el fichero en un sitio accesible, normalmente se hace en el /home, en el Escritorio o donde quieras. Luego lo descomprimes y te sitúas dentro del directorio ya descomprimido (esto ya lo tienes que hacer desde el terminal cd /loquesea ) y desde ahí ya operas los comandos necesarios.

He seguido tus indicaciones al dedillo invi :lee: y esto es lo que me dice el terminal:

Código: [Seleccionar]
jordi@JoRdi-pc:~$ cd /opendicom-navigator
bash: cd: /opendicom-navigator: No existe el fichero ó directorio

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: invisible en 22 ene 2010, 05:33 am
He seguido tus indicaciones al dedillo invi :lee: y esto es lo que me dice el terminal:
Cuando he puesto /loquesea me he querido referir a la ruta completa hasta el directorio, es decir, si lo has descargado en tu escritorio, sería algo así como cd /home/jordi/Escritorio o bien cd ~/Escritorio, porque no creo que lo hayas descargado y descomprimido directamente sobre la raiz / ¿o sí? :??
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 22 ene 2010, 05:41 am
Buenas,

Cuando he puesto /loquesea me he querido referir a la ruta completa hasta el directorio...si lo has descargado en tu escritorio, sería algo así como cd /home/jordi/Escritorio o bien cd ~/Escritorio...

¡Entendido cocina!, voy a ver que es lo que consigo :-v-

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 22 ene 2010, 05:45 am
Buenas de nuevo,

Poco a poco voy cogiendo el concepto, uno que no está acostumbrado a este tipo de instalaciones :sonroja2: , pues de momento hasta aquí he llegado, ya empezamos con los errores:

Código: [Seleccionar]
jordi@JoRdi-pc:~$ cd /home/jordi/opendicom-navigator
jordi@JoRdi-pc:~/opendicom-navigator$ make clean
jordi@JoRdi-pc:~/opendicom-navigator$ make
Looking for command mcs ... FAILED.
make: *** [build] Error 1
jordi@JoRdi-pc:~/opendicom-navigator$

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: redy en 22 ene 2010, 08:16 am
Looking for command mcs ... FAILED.

mcs es el compilador de mono (mono compiler suite). Mono es el equivalente libre de .net de hasefroch.

Mira a ver si tienes un paquete mono-mcs o mcs e instálalo junto con las dependencias que requiera.
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 22 ene 2010, 09:00 am
Buenas,

Mira a ver si tienes un paquete mono-mcs o mcs e instálalo junto con las dependencias que requiera.

Gracias redy q:) , voy a ver si lo tengo en los repositorios :lee:

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 23 ene 2010, 08:42 am
Buenas,

Mira a ver si tienes un paquete mono-mcs o mcs e instálalo junto con las dependencias que requiera.

He encontrado en los repositorios de ubuntu mono-mcs y lo he instalado junto con las dependencias requeridas y este ha sido el resultado:

Código: [Seleccionar]
jordi@JoRdi-pc:~$ cd /home/jordi/opendicom-navigator
jordi@JoRdi-pc:~/opendicom-navigator$ make clean
jordi@JoRdi-pc:~/opendicom-navigator$ make
Looking for command mcs ... FAILED.
make: *** [build] Error 1
jordi@JoRdi-pc:~/opendicom-navigator$

He estado indagando más en el asunto y he visto que también hay disponible en los repositorios mono-gmcs y mono-smcs, ¿es posible que tenga también que instalar una de estas dos opciones o las dos? :?

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: Colegota en 23 ene 2010, 16:19 pm
Cuando compilas suele guardarse un fichero con la información más detallada. Mira a ver si tienes alguno que te de más datos sobre el error.

También se suele usar antes de $ make un $./configure que te dice si te faltan cosas para hacer el make. Revisa el install a ver si dice algo más.

Estoy con el cutrestar y no me da para investigar más porque apenas me conecta con google. :(
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: invisible en 23 ene 2010, 18:16 pm
JoRdi; yo, con el med-imaging he podido abrir algun .dcm que me he bajado de la web. No sé si los ficheros que tú tienes necesitan algo más... :ejem:
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 24 ene 2010, 20:27 pm
Buenas,

Seguiré investigando :lee: , a ver si consigo algo, gracias socios q:)

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 25 ene 2010, 08:04 am
Buenas,

He estado investigando y he llegado a un punto muerto :cabezazos: . He instalado de los repositorios de Ubuntu el mono-gmcs y el mono-smcs, esto no me ha ayudado en nada, también he descargado e instalado el opendicom-sharp, ya que me lo ha pedido en un punto de la instalación, pero todavía tengo errores y no avanzo.

De momento voy a hacer un alto en el camino, estoy invirtiendo demasiado tiempo en todo esto y la verdad es que actualmente no me sobra mucho, como que era para curiosear las resonancias magnéticas, lógicamente yo no se interpretarlas, para eso están los médicos, prefiero destinar mi tiempo libre en la comunidad y como no en la fotografía, que hace un montón de tiempo que tengo la cámara en el armario y la pobre seguro que debe de tener hasta telarañas.

Gracias a todos por el tiempo que me habéis dedicado, si en un futuro, cuando me sobre tiempo, me dedico otra vez a ello ya os tendré informados, seguro que vuelvo a necesitar vuestra gran ayuda socios :colegas: , gracias :asias:

Ta lu3go
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: invisible en 25 ene 2010, 08:17 am
... De momento voy a hacer un alto en el camino...

... como que era para curiosear las resonancias magnéticas, lógicamente yo no se interpretarlas, para eso están los médicos...

... prefiero destinar mi tiempo libre...

... si en un futuro, cuando me sobre tiempo, me dedico otra vez a ello ya os tendré informados, seguro que vuelvo a necesitar vuestra gran ayuda...

 ::)  :collejas:
Título: Re: Programa para ejecutar resonancia magnética
Publicado por: JoRdi en 25 ene 2010, 16:09 pm
::)  :collejas:

 :sonroja2:

Ta lu3go